天、地、气、水、人五位一体的思想，是侗医学术思想的核心。侗歌“古闷冬庚系韭梭，得地长庚系冷垠”，“索冷拱晕庚畏病，庚对董梭转变冷”，意为“天上生人是股气，地下养人是水和土”，“气多气少人遭病，人死断气精化水”。侗医和冲傩认为，天是看不见顶的庞然大物，是股气，地是有形之物，即土和水；人是气所生的，由土和水所养。这就是侗家的“天人，’和“地人”之说。在《人类起源》侗歌中的四个“奶奶”以及他们所生的松恩、松桑就是“天人”的代表；，洪水滔天，人烟绝迹；，十二兄妹只好婚配，便是“地人”的化身。人的起源与五位一体的思想，是侗族先民们通过长期观察，对人的起源与自然界的关系产生的基本概念。

　　在生理功能方面，侗歌有“庚寥凡间呃瞑久，全靠枚索和枚冷”，意为“人的生存没多久，依靠有气和有水”，说明气和水在维持人体功能活动方面的重要性。在临床治疗上，侗医非常重视气和水的作用，常常使用补气、补水方法。在用药上，凡是块根及甜味药物，都作补水、补血之用。侗医对血和水的认识是同意词，血和水在体内是同一物，统称“血水”。

　　在病理方面，侗歌“索冷拱晕庚畏病，庚对董梭转变冷”，意为“气多气少人生病，人死断气精化水”。侗医认为气和水两者失去平衡，人就要生病；气和水由量变到质变，是疾病的病理过程。

　　对致病因素的认识。侗歌“呃偻叽构呃病，佟病都系逗亮，闷敦、漾冷、淋霖、抖仑，优喉、瘟、蜥、猛、历、娘、毒蕾、判妞、斗奈相害庚”，意为“谁吃粮会不生病，生病都是着凉、天热、湿水、淋雨、受风、饱饿、发瘟、蛇、虎、虫、草、鬼、山神这些降给人的”。这些认识虽然是从感性的形象思维出发，但其概念还是明确的。

　　侗医认为饮食是维持生命的能量泉源，但是如果饮食过多，不加以节制，或者吃的过少，都将影响身体健康，甚至造成疾病。侗医有“犯酒、犯肉、犯谷、犯气”之说：酒性热除寒，饮用适度可调人体血脉情志，如果用量过多可伤神伤志，“心神受扰，百病丛生”；肉类补血补体，食用过多反而伤血伤水；谷类养万物，亦不可过饱，过饱伤身；气：是生命的根本，不可“犯气”，不犯气指两个方面：一是平时要保持“心平气和”，为人善良，遇事不可性急；二是不可忧郁寡言，伤心伤神。“气与神”是相互联结的，伤一不可。

　　对于药物的性味，侗医认为“药苦能退热，药涩能止泻，药香能清肿止痛，关节痛要用药叶为生”。

　　侗药有六性六味理论，给侗医临床用药提供了理论基础及用药依据。用药先要掌握六性六味，再根据疾病的临床表现确定用药。如冷病用热药，热病用冷药，用药才能对症，否则不但治不好病，甚至会出现不良后果。

　　六味为酸涩、苦、辣、香、淡、甜。六味是通过人的味觉识别出来的。